Перейти к содержимому

  • Войти с помощью Facebook Войти с помощью Twitter Log In with Google      Войти   
  • Регистрация

Фото

Древние ДНК (материалы по палеоДНК).


  • Чтобы отвечать, сперва войдите на форум
73 ответов в теме

#61 kir

kir

    Homo heidelbergensis

  • Участник
  • 256 Сообщений:
19

Опубликовано 14 Август 2018 - 17:16

https://www.nature.c...1586-018-0094-2
https://www.biorxiv....18/05/16/322347
https://genetiker.fi...3/all-33-14.png
https://www.gnxp.com...f-of-west-asia/
  • 0

#62 Mirandoisa

Mirandoisa

    Homo heidelbergensis

  • Участник
  • 259 Сообщений:
58

Опубликовано 14 Сентябрь 2018 - 09:42

Комментарий ?.Л. Рожанского по ДДНК лангобардов:

 

 Следует особо остановиться на образце из ?талии CL31, у которого определили субклад G2a1-Z6644, преобладающий у современных осетин, карачаевцев и балкарцев. Авторы статьи были явно озадачены тем, что ADMIXTURE насчитала у него внушительную долю восточноазиатской компоненты, и перепроверяли его отдельно. В итоге пришли к выводу, что результат ненадежен из-за сильной загрязненности образца. Но настолько ли он был загрязнен, чтобы списывать его со счетов? Тот же самый субклад был найден у жившего в то же время хазарина из Салтово-Маятской культуры (DA190), а у алан с Северного Кавказа обнаружили сибирские субклады Q-L330 (DA161) и Q-YP4000 (DA162). Азиатская компонента у них у всех, разумеется присутствует. Остается признать, что тот человек, похороненный по христианскому обряду близ современного Турина, все-таки был степняком или недавним потомком степняка, которого судьба занесла в Северную ?талию за компанию с лангобардами. Может быть, и алан.

 

 langobards.jpg

По данным из ?талии хорошо видно, что собственно лангобарды, потомки северогерманских племен, представлены на этом кладбище элитой, состоявшей в близком родстве. Остальные - это микс из местных уроженцев и/или выходцев из Южной Германии. Не удивительно, что лангобарды подверглись полной романизации за 1-2 поколения. Любопытно, что терминальный для рода CL1 снип Z381 является также терминальным для династии Бурбонов. Ее самый ранний документированный предок - это франкский феодал Роберт Сильный (ум. 866), первый граф Парижа. Франки, как и лангобарды, происходили из племен, живших у южного побережья Балтики. ?х родство, подтвержденное ныне по ископаемой ДНК, не помешало им вести между собой кровопролитные войны, закончившиеся в итоге исчезновением лангобардов с исторической арены.


  • 0

#63 Mirandoisa

Mirandoisa

    Homo heidelbergensis

  • Участник
  • 259 Сообщений:
58

Опубликовано 06 Октябрь 2018 - 15:34

http://advances.scie...t/4/10/eaat4457

https://docs.google....92mo/edit#gid=0


  • 0

#64 adzans

adzans

    Homo heidelbergensis

  • Участник
  • 243 Сообщений:
19

Опубликовано 08 Октябрь 2018 - 17:15

читал читал и ничего не понял


  • 0

#65 Mirandoisa

Mirandoisa

    Homo heidelbergensis

  • Участник
  • 259 Сообщений:
58

Опубликовано 09 Октябрь 2018 - 21:21

https://www.nature.c...8-33067-w#Sec21

https://docs.google....x0JQ/edit#gid=0

 

PL_N28 - G2a - G-PF3345*


  • 0

#66 Mirandoisa

Mirandoisa

    Homo heidelbergensis

  • Участник
  • 259 Сообщений:
58

Опубликовано 21 Январь 2019 - 16:58

https://www.academia...18._С._180-191 

 

bded85c8172d.png
 
5a86bc7278d3.png
 
445596885e3c.png

  • 0

#67 Mirandoisa

Mirandoisa

    Homo heidelbergensis

  • Участник
  • 259 Сообщений:
58

Опубликовано 04 Февраль 2019 - 11:15

https://www.nature.c...467-018-08220-8

 

Ancient human genome-wide data from a 3000-year interval in the Caucasus corresponds with eco-geographic regions
  • 0

#68 Mirandoisa

Mirandoisa

    Homo heidelbergensis

  • Участник
  • 259 Сообщений:
58

Опубликовано 13 Апрель 2019 - 13:40

https://www.biorxiv....0.1101/597997v1

https://www.ebi.ac.u...view/PRJEB31764

56384050_10157107363654297_7443484799949


  • 0

#69 Mirandoisa

Mirandoisa

    Homo heidelbergensis

  • Участник
  • 259 Сообщений:
58

Опубликовано 06 Май 2019 - 12:21

Screenshot-20190504-090206-Drive.jpg

https://papers.ssrn....ract_id=3346985

 

Ожидается новая статья по скифам, в которой из 31 образца определили полтора десятка мужских Y дднк. Восточноазиатские линии и монголоидная примесь скифов вероятно от мужских линий Q1c-L332   

 

"Кочевые скифы раннего железного века были описаны как конфедерация племен различного происхождения, основанная на древних свидетельствах ДНК. До сих пор неясно, насколько скифское господство в Евразийской степи было связано с перемещениями людей и насколько отражало культурную диффузию и господство элиты. Мы представляем новые последовательности целых геномов 31 древней Западной и Восточной Степной особи, включая скифов, а также образцы, предшествующие и постдатирующие им, что позволяет нам установить скифов во временном контексте (в Западной/Понто - Каспийской степи). В начале скифского господства в Понто-Каспийском генофонде раннего железного века мы обнаруживаем увеличение Восточного (Алтайского) сродства наряду со снижением Восточного (эгг) предка охотника - собирателя. С другой стороны, образцы Черняховской культуры, датируемые скифами в Украине, имеют значительно более высокую долю ближневосточной родословной, чем другие образцы данного исследования. Наши результаты согласуются с Готским источником Черняховской культуры и подтверждают гипотезу о том, что скифское господство действительно включало в себя демический компонент."


  • 0

#70 Mirandoisa

Mirandoisa

    Homo heidelbergensis

  • Участник
  • 259 Сообщений:
58

Опубликовано 02 Июнь 2019 - 16:06

http://www.anatole-k.../09_06_2016.pdf стали известны двадцатимаркерные результаты исследования палеоднк из хазарских захоронений  кутейниковское  и таловское в Ростовской области

Хазар дДНК R1a-Z93 -14 25 16 11 10 14 10 13 11 33 15 24 14 20 33 11 15 19 11 23

Хазар дДНК R1a-Z93 -13 25 16 11 11 15 10 13 11 32 16 24 14 20 32 13 15 18 11 23

 

 Главный государственный центр судебно-медицинских и криминалистических экспертиз Министерства обороны Российской Федерации, г. Ростов-на-Дону Татьяна Г. Фалеева tatiana.fal@mail.ru 

 

На прошедшей в Москве конференции https://yadi.sk/i/mm41BA9GTJv-Bw  анонсирована скорая публикация нового дднк исследования по элитным захоронениям хазарской знати. По имеющейся предварительной инсайдерской информации все исследованные образцы имели гаплогруппу R1a  и только один гаплогруппу Q. По аутосомам результаты хазар оказались далеки от еврейских ашкеназийских популяций и близки к некоторым северокавказцам и кочевникам. Надо ещё отметить, что ранее опубликованный образец дднк G2a1 из салтовомаяцких захоронений так называемых хазарских конфедератов: №56   DA190 ERS2374392 SaltovoMayaki Caspian steppe 1283 G-Z6653 https://docs.google....FC3Rik/htmlview , не вписывается в общую картину хазар ни  по характеру погребения, ни по выявленной мужской Y-гаплогруппе, а значит возрастает вероятность принадлежности этого салтлвомаяцкого G2a1  к аланской группе захоронений.


  • 0

#71 BAazi

BAazi

    Homo erectus

  • Участник
  • 41 Сообщений:
5

Опубликовано 18 Июнь 2019 - 20:10

https://phylogeograp...r-match-finder/

 

https://phylogeograp...P2z_cxPPY7D9ShI

 

https://docs.google....t#gid=255460234


  • 0

#72 Mirandoisa

Mirandoisa

    Homo heidelbergensis

  • Участник
  • 259 Сообщений:
58

Опубликовано 10 Январь 2020 - 13:12

https://www.biorxiv.....12.15.876912v1


  • 0

#73 Mirandoisa

Mirandoisa

    Homo heidelbergensis

  • Участник
  • 259 Сообщений:
58

Опубликовано 24 Январь 2020 - 22:34

Генетический анализ мужчин венгерских завоевателей

12520_2019_996_Fig3_HTML.png?as=webp

KEI/3 G2a1-L293 94.3% G2a1-L293
RT/7 G2a1-L293 97.9% G2a1-L293
RP/1 G2a2b2a1 98.5% G2a2-U1 > L1266
RP/2 G2a2b2a1 99.9% G2a2-U1 > L1266

Kарос-Эперьесгёг I, могила 3 ​​(KEI / 3) и часть Ракамаза-Туроци, могила 7 (RT / 7): G2a1-P18, L293

Эти два скелетных останка дали результаты в сравнительно небольшом количестве локусов, поэтому сеть для них создать не удалось. Основываясь на существующих анализах STR, они, скорее всего, относятся к подгруппе G2a1-L293, что характерно для северокавказских ираноязычных осетин. Десять маркеров из останков Ракамаза были исследованы и выявили 7 совпадений среди этнических групп из исследования Balanovsky et al. ( 2011 ): 1 образец осетинского P18 (2 генетических шага далеко), 4 осетина, 1 дагестанский авар и 1 абхазский P18 образец (3 генетических шага). Только семь маркеров из останков скелета Кароса можно сравнить с исследованием Балановского и др. ( 2011 ), в котором образец могилы Кароса 3 полностью генетически соответствует 1 осетинскому, 1 абхазскому и 1 черкесскому. Еще 9 осетин, 5 чеченцев, 3 черкесов и 2 абхаза находятся в 1 генетическом шаге. Однако из-за небольшого количества сопоставимых маркеров эти совпадения не обязательно предполагают тесную генетическую связь. Ни один из образцов G2a1-L293 не имеет известного современного венгерского потомка, и при этом они не могут быть родственниками из-за многочисленных генетических различий.

Rétközberencs-Paromdomb, могилы 1 (RP / 1) и 2 (RP / 2): G2a2-U1, L1266

Генетические маркеры двух особей мужского пола из могил Rétközberencs-Paromdomb 1 и 2 идентичны, поэтому они могут быть близкими родственниками. Гаплотип образцов может принадлежать либо к группе G2a2-L1259 U1 (xL13), которая распространилась с ранними земледельцами, либо к подгруппе L1266 (см. Рис.  9 ), которая, согласно Rootsi et al. ( 2012 ), породил патрилинейную ветвь народов Северо-Западного Кавказа (абхазов, абазинов, адыгов / черкесов и кабардинцев). Ближайшее совпадение - 2 генетических шага. Это ставит общего предка венгерского завоевателя и 2 образца абхазского, 1 абазинского, 1 карачаевского и 1 западно-китайского уйгуров в ранний хазарский период. Интересно, что, несмотря на кавказскую природу группы, гаплотип основателя совпадает только с современным венгерским и эстонским образцом , от которых образцы венгерского завоевателя в 3 шагах. Группа могла быть включена в генофонд венгерских завоевателей на предкавказье.


  • 0

#74 Mirandoisa

Mirandoisa

    Homo heidelbergensis

  • Участник
  • 259 Сообщений:
58

Опубликовано 26 Февраль 2020 - 15:49

С.Козлов: При сравнении современных кавказцев с древними аланскими образцами по IBD-сегментам   в итоге  так и не получилось вывести какой-то чёткой связи с определённым народом. С Кавказом в целом — да, получается общих сегментов явно больше, чем с восточноевропейцами (в качестве их представителей я взял выборки русских и татар). К сожалению, по распределениям внутри Кавказа убедительной закономерности по-прежнему не вижу. Мне и самому не нравится невнятность результата, но может, так оно и вернее. Сомнительно, чтобы за прошедшие тысячелетия где-то сохранились первозданно чистые аланские аутосомы.
Ваши осетинские геномы действительно обычно имеют больше общих сегментов с аланами, чем «научные» осетины. Однако это же справедливо и для других выборок — коммерческие геномы пересекаются с древними аланами лучше, чем научные. Наверное, коммерческие отсеквенировали более качественно, или же причина в чём-то другом.
В итоге, при одних настройках впереди осетины, при чуть других — кто-то ещё. Однако видно, что «научные» образцы S1-S3 чаще всего внизу. Тут явно есть объективная разница, а вот разница между коммерческими образцами больше похожа на случайные изменения.
MTA не раскрывают своих алгоритмов, поэтому я не знаю, за счёт чего у них получилось такое преимущество у осетинских образцов. Понятно лишь, что количество используемых при сравнении снипов у MTA гораздо меньше, поэтому сегменты получаются такими огромными (согласно моим предположениям, при этом слипается вместе множество мелких сегментов). Я использовал чуть более трети снипов от старого чипа FTDNA. Такое ограничение необходимо для совместимости с научными выборками, так как многие снипы у них отсутствуют. Однако в остатке всё равно большое число, около 245 тысяч штук. Этого достаточно для корректного сравнения.
Также стоит отметить, что при одинаковых настройках суммы пересечений с DA162 обычно меньше, чем с DA243. Это вызвано тем, что DA243 прочитан более качественно, а значит, там меньше лже-разрывов сегментов из-за непрочтённых аллелей.


  • 0




0 пользователей читают эту тему

0 пользователей, 0 гостей, 0 невидимых